SimplificationHEADmaster

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diff --git a/README.md b/README.md
index 2c56d27..f10e8d2 100644
--- a/README.md
+++ b/README.md
@@ -1,10 +1,65 @@
 ** Example Usage
 
-```sh
-for file in data/HT-*/; do ./run.sh `basename $file`; done
+For the following labelling input structure
+```
+data/
+├── test
+│   ├── HT-A1
+│   │   ├── Label1.tif
+│   │   ├── OtherLabel.tif
+│   │   ├── NameMe.tif
+│   │   └── A1.labels.tif[4].tif
+│   └── HT-A2
+│       ├── Label.tif
+│       ├── 2.tif
+│       └── A2.tif
+└── train
+    ├── HT-B1
+    │   └── B1.labels.tif[0].tif
+    ├── HT-B2
+    │   ├── B2.tif\ [1].tif
+    │   ├── B2.tif\ [2].tif
+    │   └── B2.tif\ [3].tif
+    ├── HT-C5
+    │   ├── C5.tif\ [1].tif
+    │   ├── C5.tif\ [2].tif
+    │   └── C5.tif\ [3].tif
+    └── HT-J9
+        └── J9.tif[1].tif
 ```
 
+Simply run:
 ```sh
-mkdir -p output/small/
-./build/prog sample_data/small output/small/small.bin output/small/small.png
+./buildall.sh
+```
+
+To get:
+```
+output/
+├── test
+│   ├── HT-A1.bin
+│   ├── HT-A1.png
+│   ├── HT-A1_seg.npy
+│   ├── HT-A1.tif
+│   ├── HT-A2.bin
+│   ├── HT-A2.png
+│   ├── HT-A2_seg.npy
+│   └── HT-A2.tif
+└── train
+    ├── HT-B1.bin
+    ├── HT-B1.png
+    ├── HT-B1_seg.npy
+    ├── HT-B1.tif
+    ├── HT-B2.bin
+    ├── HT-B2.png
+    ├── HT-B2_seg.npy
+    ├── HT-B2.tif
+    ├── HT-C5.bin
+    ├── HT-C5.png
+    ├── HT-C5_seg.npy
+    ├── HT-C5.tif
+    ├── HT-J9.bin
+    ├── HT-J9.png
+    ├── HT-J9_seg.npy
+    └── HT-J9.tif
 ```